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拉曼光譜助力 新型納米孔器件有望用于表觀遺傳學快速測序

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  比利時校際微電子中心(IMEC)9日發表公報說,該中心成功開發出一種能直接讀取單分子DNA(脫氧核糖核酸)堿基的新型光學納米孔器件,有望用于遺傳學研究快捷測序。

  據介紹,新型器件結合了表面增強拉曼光譜和納米孔流體技術,能以超高分辨率,實現無標記檢測DNA中的遺傳編碼以及表觀遺傳變異。研究近期發表在英國《自然·通訊》雜志上。

  具體來說,這項技術通過納米流體技術驅動DNA分子穿過一種拉長的納米孔結構--表面等離子體納米縫。而拉曼光譜是一種可反映分子特征結構的分子振動光譜。當DNA分子穿過納米縫時,就會同時激發表面增強拉曼光譜,提供堿基分子的“指紋圖”,以達到化學鍵水平的精準識別。

  據介紹,這種新型納米孔器件不僅可以“讀取”DNA編碼,還可以“讀取”堿基的各種化學修飾產物。這些修飾產物通常攜帶了與表觀遺傳變異相關的大量信息,同時它們也影響細胞中的基因表達,對進化研究和分析癌癥等疾病的發展具有重要意義。

  表觀遺傳學是遺傳學研究中最為前沿的領域之一,研究基因的DNA序列不發生改變的情況下,基因表達發生了可遺傳的改變等現象。目前使用的表觀遺傳測序方法大都繁瑣費時且價格昂貴。新型器件“是向開發可用于表觀遺傳學研究的快捷測序方案邁出的重要一步”,IMEC資深研究員陳昌博士說。

  比利時校際微電子中心成立于1984年,是一家在納米電子、能源和數字技術研究和創新領域領先的獨立研究中心,總部位于比利時魯汶,并在荷蘭、美國和中國等地擁有研發小組。


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